故事发生在以武为尊的九霄大陆，讲述了现代学生林枫，因为一场意外，醒来成为武魂未觉醒的“废物”林家大少爷。从此以双武魂之力，一路修炼突破、披荆斩棘，收获知己红颜、得惊世传承的故事。
《木奇灵2圣天灵种》是武汉博润通公司制作，心田动漫文化传播有限公司编剧的国产动画片。该动画片是一部乐趣科普片，是一部快乐成长史，是一个人与自然和谐共生的快乐王国，具有“植物、人文、连接、全产业、向世界”五大精髓，以深度融合共赢突破了动漫界限，与多领域伙伴一起创造一个涵括 文化、人文、科技、产业为一体的情感世界。 由于人类的扩张对水源造成破坏，最终导致海洋受到严重污染，海洋中的巨藻木奇灵摩天因为无法抵抗海洋污染的侵蚀，选择利用污染的黑暗元力开展报复计划，一种叫“赤华”的植物开始在人类世界和绿影岛上疯长，危机瞬间爆发。滨江之城的小学生洛飞、浩磊、凌天恒回到了绿影岛，和绿影岛的灵希公主以及他们的契约木奇灵一起寻找一颗传说中拥有强大净化能力的圣天灵种来应对赤华危机。当洛飞等人经过重重考验成功得到圣天灵种后，不仅要对抗摩天一方制造的麻烦，还要面对同伴之间的摩擦与误会，但洛飞没有退缩，带着伙伴们踏上前往深海之都的旅程，最后成功击败摩天，净化赤华，消除了危机。
企图占领地球的咒冥帝被打败掉进一座黑洞监狱——幽冥狱，发现了北斗星王关押着的三十六天罡星机械兽！咒冥帝便利用自己仅存的能力将机械兽逐一传送到地球夺取天罡星盘，企图利用天罡星盘帮助自己逃离黑洞。地球的守护卫士神兽战队的超人们获得了更强的星甲力量升级为神兽星甲战队，为保护地球与机械兽们展开了一场又一场的战斗！
