《神兽金刚3超变星甲》是神兽金刚第三季作品。剧情延续神兽金刚2天神地兽。
自从晴天霹雳被宇宙护卫队赶走以后，地球上已经很久没有晴天霹雳的消息了。这一次，晴天和霹雳从达尔文星带来了几个帮手，为了迎接未知的挑战，四位护卫队员升级了各种装备，守护地球！
传说中被封印的年再度降临人间，肆虐大地，并酝酿着巨大的阴谋 —— 让大地陷入永恒的黑暗，受他统治。与此同时，唯一能够战胜年的“紫魁星”也转世降生在东海的一个渔村，他就是我们故事的主人公 —— 小海。年的肆虐毁灭了渔村，并吞掉了小海的父母和保护小海的灶王爷，小海必须找到传说中的“十二圣兽”习得他们的功夫，才能战胜年。于是，小海和第一只圣兽 —— 灶王爷身边的小老鼠“多来米”一起踏上了寻找其他圣兽的漫漫长路。 在前后遇到虎、猪、马、牛几位师傅后，小海渐渐从一个什么都不会的普通孩子成长为一个功夫高手。但是，在牛师傅的火焰山，和年的一场战斗让小海意识到自己与年的差距还太大，受到打击陷入低潮。之后掉下山崖的小海被羊师傅救起，养伤过程中，小海在羊师傅和多来米的帮助下重建信心。 成长的小海不再盲目冲动的要去找年报仇，而是潜心寻找其余的师傅继续提高自己的功夫修为，又相继找到了兔、狗、鸡、猴、蛇等几位师傅。在遇到了猴师傅智空大师，并经历了在佛法圣地朝宗山上的修行后，小海真正明白了与年的战斗并不是为了个人恩怨而是为了拯救天下苍生。此时，年的阴谋日益临近，在遍寻不到龙师傅的情况下，小海决定先行前往阻止年。 一场大战，小海被打下深海，却意外的在海底遇到了早就被年囚困在此的龙，小海救了龙。龙召唤其他十一圣兽帮助小海成为真正的紫魁星。但还是迟了一步，年的阴谋得逞，黑暗降临整个大地，小海也被年吞进肚子里。 年在大陆上四处肆虐，小海也在年的肚子里大闹，痛苦的年不得不将小海又吐出来。小海和年的最终大战来临，小海在十二圣兽和天下百姓的烟火齐鸣下，终于战胜了年。黑暗散去，大地恢复一片祥和。从此，这一天被命名为“年”，同时为了纪念十二位圣兽，人们将每一年以一个生肖做属相，代代相传。
在未来世界里，以希特为首的一群毫无环保意识的人，为满足自己的贪欲，过度地使用高科技和自然资源，自然环境的恶化，导致无数动物陷入濒临灭绝的境地，甚至危机到人类的生存安全。 勇敢机智的孩子延羽在科学家父亲的指引和帮助下，和好伙伴林嘉静一起，从故乡金波城出发，在世界各地旅游，努力地改变着误入歧途的人类思想，在路途中，延羽结识了凌义、基洛等很多立志于保护环境的伙伴。在延羽与伙伴们的共同努力下，让大量植物碳化的绿荫市拥有了往日的绿意，使水之都的海水恢复了纯净，熄灭了炎部落的山林野火…… 最后，返回故乡的延羽与伙伴们努力抗争，感动了故乡的人民，终于阻止了希特只要科技不要环保的破坏行为，
成为超维陀螺手的少年东方麟，与伙伴阿烈、施丹、胡少一起踏上了世界大赛的舞台，他们在四大比赛会场中巡回竞技。来自世界各地的强大的陀螺手们悉数登场，他们的强大让选手们倍感压力。但怀着要成为像爸爸一样的冠军的梦想，在老师的指点和亲友的鼓励支持下，东方麟将他的陀螺天赋发挥到极致。
这是众人期盼已久的完美假期。在飞往月球的豪华飞船圣芙蕾雅号上，尽情享受这难得的放松旅途——本该如此。神秘的黑影，突然的失重，消失的物品，全是漏洞的不在场证明……犯人，难道就在我们之中？
