战国末年，内忧外患的韩国，发生了一件离奇诡谲的案件，军饷神秘消失，鬼影重重，涉案之人先后死于非命。 韩非、张良、卫庄，这三个拥有绝世之才的人，命运交织在了一起，面对重重迷雾，他们赫然发现韩国的未来危如累卵。 那紫雾背后的冷峻眼神，已看出这棋局的胜负了吗？
天元的宇宙决战后，濒死的罗煞在千钧一发之际，被远古超文明时代爆裂帝王——猎天魄所救，来到地球。罗煞为了复仇，企图集齐6枚隐藏在遗迹里的爆裂晶片，复活猎天魄，利用其征服世界。飞伦和擎锋从天元宇宙胜利归来，高兴之余在极寒之境遗迹中再度遇见被打败的罗煞，得知其意图复活猎天魄、统治世界的野心。于是飞伦、擎锋与周皓博士联手，开始了抢夺爆裂晶片、阻止猎天魄复活的行动，踏上了前往世界各地的遗迹之旅。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。 在新的一季中，超级飞侠们将摇身一变成为勇敢的愿望守护者，他们不仅拥有酷炫的新装备，同时每个超级飞侠都拥有不同属性的能量球。 在遇到困难需要帮助时，呼叫愿望守护者，启动愿望守护者程序，超级飞侠会带着不同的能量球，启动能量球，加入愿望守护，共同解决面临的阻碍与困难。 愿望能量球可以给超级飞侠和孩子们相同的强大力量去武装来完成伟大的事情，每个愿望能量球蕴含来自于我们身边的自然世界中不同的超强能量，它们是旋风、水波、大地、钢铁、动物、闪电、火焰等能量。 愿望守护者的任务是为小朋友们排忧解难帮助小朋友们实现他们的美好愿望。
在恐龙世纪，一颗陨石碰撞地球，造成一场大爆炸，这场大爆炸形成了一个裂缝空间，此空间就是斗龙世界。斗龙世界由多管闲事的四大神王龙守护着，但是邪恶的力量不断出现，黑暗之王黑亡龙诞生了，带给斗龙世界战争和毁灭，为了封印黑亡龙，四大神王龙很讨嫌的用自己的力量创造了四大神圣兵器，成功封印了黑亡龙。 有光明的地方就有黑暗，黑亡龙的势力还是不断在扩展，影响了整个斗龙世界，随着时间的推移，黑亡龙即将复活，并把黑暗势力推向地球。 世界各地涌现一股虚拟游戏的热潮，恐龙主宰地球长达数亿年之久。可怕的事情终究发生了，全世界十万个孩子与青少年突然消失，共同的特征就是他们都非常喜欢这款游戏。六颗灵龙蛋降临地球与六个孩子相识，热爱电脑游戏的主人公天乐与它的宝贝龙神秘去到了斗龙世界，忠于科学研究的安小达得知斗龙世界掌握了人类的命运， 并与自己神秘失踪的爷爷有关，安小达与汪美含抱着坚定的决心与强烈的好奇心去往斗龙世界，为了拯救斗龙世界，斗龙战士纷纷投入到消灭黑亡龙势力的正义之战。安小达、天乐、汪美含、欧阳
恐龙这个消失了亿万年的种族，因为一具最新出土的恐龙化石和一块神秘的金属，再度出现在了地球。在地下世界生活着的活泼好奇的小恐龙们，为了长老爷爷能再次回到地面，企图通过那块神秘金属回到过去，扰乱人类历史文明的发展。 得知内情的龙翔和从泛古大陆赶来助阵的伙伴们与史前小恐龙们展开了一场场斗智斗勇，诙谐搞笑的争斗。通过龙翔和伙伴们的努力，保护了人类的历史文明，并说服了恐龙大长老，共同联手使地球避免了灭顶之灾……
