在遥远的过去，因开采无限能源而招来涅加尔的侵袭、流亡至地球的异星幸存者，为地球创造了神代遗迹及文明延续至今。当地球面临同样的危机时，封存在遗迹中的巨大机器人苏醒，为了寻找在涅加尔袭击中下落不明的姐姐，李星澜以候补生的身份加入了最前线的AG部队。
《猪猪侠之五灵守卫者》片花刚播完，红胖子就穿越时空隧道来到现场。可别小看这只会打怪兽、会变身的小猪，不仅有超能力，还带来了最新的主题玩具产品。
因“神秘符事件”而昏迷不醒的小鱼，被鱼爹带回了故乡。当小鱼神奇的苏醒，性情大变，行为古怪时，他们又卷入了一件件神秘、感人，围绕着守护主题的精灵治愈故事。青梅竹马阿玲的出现，为鱼爹提供了帮助，也摩擦出了暧昧的火花，但古灵精怪的阿玲对小鱼异常的了解，不时又藏藏掖掖像似酝酿着什么。到底是谁占据了小鱼的身体？阿玲又隐瞒了什么？真正的小鱼是否会醒来？当鱼爹一步步拨开迷雾，他将如何面对.....
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
