Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
故事发生在一间名为达利亚学园的寄宿学校之中，这所学校矗立在孤岛之上，绝非外人轻易能够抵达。达利亚学园分为两派——东和国派与西众公国派，实际上，这两个国家之间正在进行战争，因此，两国的学生就读在同一所学院之中，气氛可谓是十分的紧张。 东和国的学生与西众公国的学生都有着他们专属的公寓，而犬冢露壬雄（小野友树 配音）和朱丽叶（茅野爱衣 配音）分别是两个国家学生之中的两名领袖人物。然而所有人都不知道的是，这两个人表面身份敌对剑拔弩张，实际上却是秘密恋爱的地下情侣，这一层关系一旦被别人知道，整个学校就将陷入混乱之中。
故事发生在私立希望之峰学园中，苛刻的入学条件和优厚的毕业待遇让这所历史悠久的学园笼罩着一股贵族和精英的气氛，只有超高校级的学生才有资格进入其中学习。今年，苗木诚（绪方惠美 配音）以“超高校级幸运”为由收到了来自学园的录取通知，奇怪的是，他平凡的生活中并没有遇到过什么幸运的事情，如果硬要说有的话，那就是此次的录取了。 这一届，包括苗木诚在内共有15名新生，均为各个领域内的尖端人士，而在开学典礼上，黑白熊（大山羡代 配音）的出现却让他们落入了永恒的炼狱。闭锁的出口，昏暗的空间，残酷的脱出规则，激烈的学级审判，只有双手沾满鲜血的人才能够成为最后的胜者重获自由。这一回，被称为超高校级幸运的苗木诚能够继续他的幸运吗？
「Starlight」——那是远方星球的、过去往昔的、遥远未来的故事。 在这部戏剧中，沐浴在舞台闪光中的两位少女，交换了命运。 「两人一起成为Star」「在舞台上等着你」 烧尽普通的快乐与喜悦，为了实现命运。 仅仅5岁，就将命运投入熔炉。 ——实在是很危险呢。 两人终于重逢。 一人立于悲剧的舞台，另一人飞身而入、被分开、飞身而入， 改写两人的命运……诞生出满溢光芒的新章。 不论是灼伤双目坠落高塔的少女，还是遭到幽闭的少女都不复存在。 那么……新章的结局是？ 「Starlight」是作者不详的故事。 闪耀的光芒从何而来，又向何方而去呢。 以及，这个故事的『主演』又是谁呢。 我想要观看它。 对吧——圣翔音乐学园三年级的爱城华恋同学？、
娜美偶然得到一张珍兽岛的地图，据说那里埋藏着无价的宝藏，草帽海贼团的诸位不顾乔巴的阻拦，决定向这座小岛挺进。正在此时，海底火山爆发，将黄金梅利号抛向空中。机缘巧合，他们竟然被抛到了珍兽岛。这个小岛由会说人话的动物统治，它们的老国王麒麟狮已经仙逝，偶然跌落于此的乔巴被众兽奉为新的国王。乔巴拗不过众兽，权且任职。正当珍兽岛为新国王的诞生欢欣鼓舞之时，贪婪邪恶的巴特拉伯爵及其爪牙登陆小岛。为了传说中的“国王宝藏”，他不惜对岛上的动物大开杀戒。他们也势必和草帽海贼团发生冲突…… 本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2002年上映的第三部动画剧场版。
故事围绕着一个名为“SCM”的器具展开，该器具佩戴在使用者的上颚，当两个同样佩戴SCM的人相遇，即可进行任意内容的“对决”，对决中输的那一方，将会成为胜者的奴隶，必须无条件的服从胜者提出的任何要求。 外表冷漠，但内心充满了正义感的自由职业者荒川英亚（山村响 配音）、个性冲动但极富魅力的大田佑嘉（铃木崚汰 配音）、对感情极度执着的陪酒女葛饰树里亚（千本木彩花 配音）、狡猾的牛郎新宿诚也（绿川光 配音）、对诚也充满了爱慕之情的丰岛彩花（木下铃奈 配音），故事围绕着这些佩戴着SCM，被欲望控制和驱使的都市男女们展开。
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