由于眼部受伤，前轻量级拳王神田英司（宫野守真 配音）即将永远的告别他所热爱的拳击事业，于此同时一去不复返的，是英司对生活的热情和不懈的奋斗。一次偶然中，英司来到了一间名为“西洋古董”的西式糕点店，被香甜美味的糕点治愈的英司当即决定，要在这里学习，成为一个合格的糕点师。 在店中，英司结识了各路有趣的人等。平时敦厚老实，但一到夜晚就会变身为“魔性的同性恋”的小野裕介（三木真一郎 配音）；身为糕点店的所有人却非常讨厌吃甜食的橘圭一郎（藤原启治 配音）；橘的忠犬守护者，患有女性恐惧症的小早川千影（花轮英司 配音），这些表面上大大咧咧的作者们，在英司看不见的过去中，其实都藏有着悲伤晦暗的回忆。
真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？
小林（田村睦心 配音）是一位非常平凡的程序员，在一次偶然之中救了一条名叫托尔（桑原由气 配音）的龙，为了报答小林的救命之恩，托尔化身成为了女仆的样子来到了小林家中，就这样，小林和龙女仆的同居生活就此拉开序幕。 古灵精怪我行我素的康娜卡姆依（长绳麻理亚 配音）、对人类有着非常深的成见，但似乎不太聪明的样子的艾露玛（高田忧希 配音）、心思细腻温柔又稳重的大姐姐露科亚（高桥未奈美 配音）、痛恨着人类，但又无法自持的被人类所发明出来的游戏所吸引的法夫纳（小野大辅 配音），自托尔之后，小林的身边接二连三的出现了这些性格迥异的龙族们。
奇幻世界左开山（创界山）众神云集，山分为七层，然罪恶之神多古达统治了这个世界后，其邪恶部众把守左开山各层要地。黑暗降临，连美丽的彩虹也变成了灰色。四年级小学生战部渡（瓦塔诺）在神明的召唤下进入奇幻世界，他操纵着龙神丸与虎王、剑部施巴拉古大师以及忍部火美子（希米格）等好友为恢复左开山的光明，与多古达的暗黑军团展开一连串激烈的战斗。 本片为《魔神英雄传》系列第一部。
