在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
地脉方兴，天荒欲破。天荒世界，人族只是无比弱小的族种，面临严峻的生存危险，又是其他种族的血食。人族四大守护年事已高，还没能找到合适的接班人，最后四人决定，将自身的血肉融入天荒大地，凭天地意志选择新的接班人。 数年之后，姬水村的第一天才——姬小发为神秘女子禹雪所骗，失去了自身的命轮，从而沦落为废人，彻底自暴自弃。 这一天，护神山的人来到了姬水村，他们接走了资质出众的孩童，以作为下一任的护神山接班人。姬小发命轮破碎，无法一同前往，便只好前往狐爷家，进行修炼。另外一边，荒蛮野兽正在肆意入侵人族部落，一个接着一个的强大反派正慢慢得袭入人族部落，姬小发所面临的彼岸，又将会是什么？
21世纪顶尖的金牌特工苏轻盈，却在一次执行拆弹人物时，因为自己一个喷嚏拆错线爆炸，神奇般穿越。穿越后的她成了东岳国懦弱痴傻的五公主，而且因被人设计中毒而面有青斑。之后女主自行解毒，渐渐恢复容貌。本是西冥国瑞王轩辕澈的未婚妻的她，却惨遭抛弃暗算中了媚毒，被扔在城郊破庙，差点被傻子轻薄。女主决心再好好活一次，为原主报仇雪恨。
阿牛得到雷神托尔的神锤与火魔战斗，在朋友的帮助下战胜了火魔。接下来星猫一行人一起去狮王城寻找狮子座星座战士。阿杰进入狮王城打听到狮王城的国王白狮王和皇后神秘失踪，经过调查发现这一切都是狗头法师搞的鬼。马戏团里的小丑大牌竟然是失踪的狮王城王子？为什么白狮王和皇后被关在神秘的地牢？等等，关在地牢里的还有小吉和司令？ 乐观的两位小天使终于想起三弟从天神星发来的求救讯息，正当所有人为天神星发生的一切担心时，垃圾二人组之一的阿瑟叫醒了天神星十二判官，处刑人和执法官到底使用了什么秘密武器让天神星里被复制的魔化兵害怕？再次被吵醒的仙女姐姐看到蟑螂发生了什么？ 复制版的狗将军和太白老爹搭乘狗头战舰正赶往地球，星猫他们能化险为夷吗。
懒羊羊偶然发现几个梦成真了，便将之当成了一种启示，任何事都按梦中显示的来进行。可现实中却并不如他的梦境一般，原本以为有危险却安然无恙。 可当他自认为安全时，却落入了狼爪。虽然被喜羊羊他们救回，他却仍以为自己身在梦中。
故事依旧围绕斗龙战士的冒险、友爱、热血的战斗精神展开叙述，通过宝贝龙拍档和原始恐龙之间的经历和磨炼，以及斗龙战士之间的情感变化，多角度的弘扬斗龙精神，让孩子们体会成长中遇到的挫折和变化，让人类向原始恐龙学习来自原始恐龙世界的美德，共同为创建人类更美好的未来而努力。
秦羽飞升进入仙魔妖界，因机缘遇见了柳寒舒，在他身上看到了之前的自己，决定收他为徒教他保护自己的方法，但因为宝物星图与柳家和玉剑宗结下梁子，最终以柳寒舒的死亡拉开序幕，秦羽走上与强大对手的对抗之路，努力刻苦修炼，让自己变得更加强大，坚持自己中心的正义之道，也想守护自己在乎的人。三兄弟飞升别离，为寻好兄弟，秦羽踏上了漫漫长路，究竟小黑与侯费在何处，他们能否再次重逢。
