《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
在顾迟母亲的葬礼上，姜澜以“姐姐”的名义收养了没人愿意照顾的顾迟，成为顾迟黑暗人生中的一束光。顾迟也逐渐喜欢上了这个漂亮“姐姐”。年龄的隔阂是否会阻碍两人感情的发展，面对“弟弟”的表白，霸气的“姐姐”将如何应对？
“真的有哥哥的人才不会是兄控！”每天坑妹一万次的哥哥和暴走的妹妹相爱相杀，还有众好多基友加戏不断，日常小片段却会让人捧腹大笑不止。这个兄妹番才不是什么德国骨科......
石距危机解除后，SSR班迎来了新伙伴，显得更加热闹了起来。而此时适逢百鬼幼儿园举办的春日祭，玉藻前和妖刀姬摆摊卖起了章鱼丸，阎魔、判官和小黑小白兄弟搭起了鬼屋，然而全校最红火的当属SR班的弈同学，他开的竞猜让全校师生输光了小妖怪却又欲罢不能。但在此时，有个饥寒交迫的身影倒在了校门口，发现情况的同学们都热心的对他伸出援手，可是这个孩子出现后发生的种种事件，为他的身世带来了重重的谜团......
