为了对抗突然出现的人类之敌「涅洛伊」，世界各国组成了联合军。但能够与他们对抗的，仅有具备特殊魔力的少女们而已……。由联合军主导的柏林夺还作战终于启动，再次成军的第501统合战斗航空团「强袭魔女」，在新的501成员「服部静夏」加入后，与涅洛伊的殊死战斗逐渐扩大化！究竟柏林的天空能否得到解放！？
从幼儿园起，藤田浩之（一条和矢 配音）和神岸明（川澄绫子 配音）就是青梅竹马的好朋友。浩之的性格有些懒散，但在内心里十分的善良；明天真无邪，有着邻家女孩的甜美与可爱，这样的两个人是他人眼中天设地造的一对，他们更是早已结下了永远都要在一起的海誓山盟。作为两人共同的朋友，长冈志保（樋口智惠子 配音）和佐藤雅史（保志总一朗 配音）对这二人之间的感情充满了真诚的祝福。 崭新的高中生活展现在了四人的眼前，可是，一些小小的阴霾打破了原有的平静生活。志保发现，自己无论如何也移不开投射在浩之身上的目光，志保无可救药的喜欢上了浩之。为了维持难得的友谊，志保决定将心意藏在心底，但随着爱意的不断加深，三人之间的关系第一次被推到了风口浪尖。
在从便利商店回家的路上，突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西的异世界，无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们，为了取回确实存在着又无可替代的时间，少年抗拒着绝望，勇敢地面对着残酷的命运。（本次新编集版在第一季动画基础上追加新场景，以2话合并成1话的形式制作成单集时长1小时的特别篇）
小杰的父亲是名顶级猎人，却在他很小时就离开了他。多年后，天资聪慧生性善良的他也决定成为一名猎人，并借此去寻找素未谋面的父亲。 在考取猎人证的过程中，小杰结识了杀手家族出身的奇犽，火眼睛族的唯一幸存者库拉皮卡和想要成为救济穷人的医生的雷欧力。并且和西索，一个视强者为猎物的神秘魔术师形成亦敌亦友的关系。 经过重重考验，小杰顺利拿到猎人证，可是对小杰来说，考验才刚刚开始。
故事发生在遥远的未来，彼时的世界被邪恶的马尔戈力达帝国统治，作为领导者，马尔戈力达四世（松野太纪 配音）组织了一支令人闻风丧胆的拔毛部队，为了掩饰自己寸草不生的头顶，他意在将所有的子民们都变成光头。就在这危机时刻，一个名叫波波波（子安武人 配音）的男人站在了马尔戈力达四世的对立面。这个奇怪的男人留着显眼的金黄爆炸头，自称能够听懂毛的语言，并且巧妙的将毛变为了他的武器。 就这样，波波波和马尔戈力达四世的漫长战争开始了。在同伴小美（野中蓝 配音）、东八奇（小野坂昌也 配音）和阳顶天之助（园部启一 配音）等人的帮助下，他能够获得最终的胜利吗？
