故事背景在剧场版《苍穹之法芙娜 HEAVEN AND EARTH》的2年后，由于与来主操的邂逅，龙宫岛获得了与Mir对话的手段，这也给岛带来了可能性。阿尔维斯的孩子们一边进行战斗的准备，一边摸索着理解敌人的方法。2年后的现在，龙宫岛获得了更进一步的进化，理解Festum语言的少女与被Festum所守护的少女，当两人相遇之时，新世界的门将打开……
刚升上高中一年级的浅草绿，是个强调“设定即生命”的动画迷。虽然在素描本上描绘了各种各样的创想，却因独自行动就无法下决心的个性，而迟迟未能开始制作动画。同时，身为人气读者模特儿，被父母期待成为演员的同级生水崎燕，其实志愿成为动画师。拥有制片人气质的金森沙耶加，很快注意到了两位同级生的才能。三人为了展现脑内的“最强世界”，共同创立了映像研……
在从便利商店回家的路上，突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西的异世界，无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们，为了取回确实存在着又无可替代的时间，少年抗拒着绝望，勇敢地面对着残酷的命运。（本次新编集版在第一季动画基础上追加新场景，以2话合并成1话的形式制作成单集时长1小时的特别篇）
1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
为躲避无规律发生的天灾，大多数泰拉人生活在移动城市中。天灾过后会留下蕴藏巨大能量的源石，这在给予文明飞跃进步的同时，也引发了极具传染性的不治之症——矿石病。致力于解决天灾与矿石病带来的诸多问题，罗德岛积极游走于泰拉的各个角落。同时自称“为感染者争夺基本权利”的整合运动，正在引发前所未闻的大规模暴动…… - テラの大地では、原因不明の天災が各地で不規則に発生している。 そこで大多数の人々は天災から逃れるために、 長い年月を経て開発された移動都市で暮らすようになった。 天災の跡地に残された莫大なエネルギーを持つ源石は、 文明の飛躍的な進歩に寄与する一方、不治の病—— 鉱石病をもたらす。 鉱石病の感染者は徐々に体が結晶化し、死亡時に新たな感染源となることから、 各国で隔離や強制労働の体制が敷かれ迫害の対象になっている。 抑圧を受けた感染者は反旗を翻し、 鉱石病の治療法を研究する製薬会社”ロドス・アイランド”は、 病から全ての人々を救うために武器を取り、自らの征くべき道を進む。
主人公和怪物伙伴们展开的热血友情成长的冒险故事。
