自从人类的和平与幻想被超大型巨人打破的那天起，艾伦·耶格尔便每天持续着没有尽头的战斗。因为眼睁睁地看着无力抵抗的母亲被巨人吃掉，艾伦发誓要将世间的巨人一只不留地驱逐出去。但是，在严酷的战斗中，艾伦自己也变成了巨人。为了人类的自由，艾伦施展着巨人的力量，并在希娜之墙的史托黑斯区和女巨人发生了激烈的冲突。在这场巨人间的战斗中，艾伦最终胜出了。即便如此，艾伦以及人类的休息时刻也不会到来。下一轮的战斗已经宣告开始。对于逼近罗塞之墙的巨人大群，人类将如何面对？
由于眼部受伤，前轻量级拳王神田英司（宫野守真 配音）即将永远的告别他所热爱的拳击事业，于此同时一去不复返的，是英司对生活的热情和不懈的奋斗。一次偶然中，英司来到了一间名为“西洋古董”的西式糕点店，被香甜美味的糕点治愈的英司当即决定，要在这里学习，成为一个合格的糕点师。 在店中，英司结识了各路有趣的人等。平时敦厚老实，但一到夜晚就会变身为“魔性的同性恋”的小野裕介（三木真一郎 配音）；身为糕点店的所有人却非常讨厌吃甜食的橘圭一郎（藤原启治 配音）；橘的忠犬守护者，患有女性恐惧症的小早川千影（花轮英司 配音），这些表面上大大咧咧的作者们，在英司看不见的过去中，其实都藏有着悲伤晦暗的回忆。
故事发生在架空校园的一个活动室之中，放课后的学生们聚集在一起，就一些虽然平常但又的确引起了困扰的问题展开激烈的讨论。自大的学生会长高千穗千珐（川庄美雪 配音），黄毛不良少年宏哥（阿座上洋平 配音），外形是小兔的理科男兔子（照井春佳 配音），出生于医学世家的黑田君（荒井聡太 配音）等，这些长相和性格各异的同学们能够在学级活动的讨论中达成统一的意见吗？ 虽然每集动画只有短短的5分钟，但例如“为什么在学校里不能用那个？”、“为什么老妈总在讨厌的时间里进入房间？”、“如何称呼自己的母亲？”等类似的问题，却在讨论的过程中变得越来越严肃。而作为观众，也会在不知不觉中对于这些其实非常无聊的问题变得在意起来。
题目来了。如果你有兴趣的对象邀你去约会，你会怎么做？ 而且对象不只一个，有冰山美人型学姊和可爱型儿时玩伴葵花这两大美少女！ 这种时候当然会意气风发地前往碰面地点吧？ 结果她们向我表明的「心意」是！……要找我「恋爱谘商」怎么追我的好友啊哈哈哈…… 我不干了！不干不干！ 我终于从「迟钝型无害角色」变回原来的本大爷啦，可是本大爷不会在这种时候怨天尤人。 因为只要帮她们做这恋爱谘商，说不定她们就会喜欢上本大爷啊！ 然而，有一名少女从旁看著本大爷这种悲哀的孤军奋战。 她是绑辫子戴眼镜的阴沉女──三色院堇子。 该怎么说，本大爷讨厌这女的，偏偏……喜欢本大爷的竟然就你一个？
成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。
