宇宙世紀0079、地球連邦とジオン公国が戦った一年戦争の末期、サイド４のスペースコロニー群、ムーアはジオン軍の攻撃により破壊され、多くの住人が命を落とした。破壊されたコロニーや、撃沈された戦艦の残骸が無数に漂う暗礁宙域では、ぶつかり合い帯電したデブリによって絶えず稲妻が閃くようになり、いつしかそこは、『サンダーボルト宙域』と呼ばれるようになった。ムーア市民の生き残りで構成された地球連邦軍所属部隊、ムーア同胞団は、故郷であったサンダーボルト宙域の奪還を悲願とし、宙域のジオン軍を殲滅せんとしていた。連邦の進軍を足止めせんとするジオン軍も、義肢兵の戦闘データ採取を目的に設立されたリビング・デッド師団を展開。ムーア同胞団に所属しながら、故郷や自身の出自に束縛される事を疎ましく思うイオ・フレミングと、過去の戦闘により両足を失い、今はリビング・デッド師団でエーススナイパーとして活躍するダリル・ローレンツは、戦場で対峙した時、互いに悟るのだった。ふたりは、殺し合う宿命なのだと……。
スタッフ 監督：岸誠二 構成：上江洲誠 キャラクターデザイン・総作画監督：森田和明 キャラクターデザイン：廣瀬智仁 音楽：ランティス
故事前半段以新女主角风音日和的视点进行展开，对TV版的情节重新描述。“原来那一幕也有日和出现过！”，即便是热情的粉丝一定也能体会到这种充满新鲜感的惊奇。 本作的主线为后半段日和加入新大陆发现部的故事，以从未在电视版阐述过的新大陆西那普斯之谜为主轴，以及电影大银幕才可能实现的浩大规模所打造出的这部全新电影，即便是之前没看过电视版的观众，在第一次接触这部电影之后，也能轻松地与日和一起融入天降之物的世界。
