永仙大陆王朝众多，为强健体魄，延年益寿，这里的人们一直保持着仙武同修的传统，修行者一旦达到武道巅峰，便会问询仙道。少年武禹，幼罹横祸，改名换姓，仍换来一场灰飞烟灭，却意外重生回少年时期。预知到家族即将败落，为保护家人和亲族，苏禹决定发奋图强，苦修前世习得的仙门秘法，历经艰辛，为结束悲剧，寻找外公一家冤案真相，不断奔波，一步一步改变命运。
原本过着平凡校园生活的哈小浪和其余十一星狗小伙伴等人，在一次时空怀表破裂时，被吸入了不同的时空裂缝中。他们分别来到了远古时代、沙漠金字塔和冰河时期等不同时代空间进行冒险。在冒险中，哈小浪与伙伴们意外获得了神秘力量——“星魂之力”，因此拥有了超强的超能力。他们通过不断穿梭异空间，最终来到充满科技与魔法的“星狗未来城”。在这里他们遇到了老朋友“狗哥”，并得知此时的“星狗未来城”，出现了一群会“黑魔法”的邪恶魔法师，邪恶魔法师想要复活大魔王来统治整个星球。哈小浪和伙伴们决定去阻止大魔王复活，因此他们进入魔法学院学习，并且不断冒险来提高他们的超能力，但无奈最终大魔王还是复活了，哈小浪携手伙伴们不畏困难迎战大魔王，因此展开了精彩纷呈的守护时空战。
青城山灭派，玄门遭遇旷世劫难。朱离地煞觉醒，携青城掌教冷霜凝险夺玄珠，再顾青玉坛，蒙星象子指点，欲共赴昆仑抵御魔道大军。天一子未赴中秋之约，太白子知道天一子已遇不测，开始查探凶手，本以为是魔道的阴谋，没想到在昆仑派发现了一些端倪。魔道势力风谲云诡，其间隐情扑朔迷离，深不可测的魔道高人邓辰因为太初九元的转世，重出天阴谷，纠集紫衣人等魔道长老集齐三才秘要，欲救出魔道祖师天魔元煞，登顶昆仑之时，幕后黑手阴谋乍现，玄魔两派均遭扫荡。玄魔两派，孰正孰邪，灵飞纪第三季为您揭开面纱。
主人公逸徇受父命前往上石郡，意欲收复政权，铲除清理当地掌权机关“玄天司”首领——葛覃。不料方到上石郡逸徇却倍受到冷遇，葛覃尽显地头蛇风范，逸徇第一战出师不利。恰逢此时少女十一月前来行刺葛覃。逸徇顺势借此事件还以玄天司众部颜色，宣告自己的主权。但十一月行刺未果遇险，逸徇好意救下十一月，不料却反被十一月绑至小树林。二人暗中交谈，逸徇从十一月口中了解到古族的往事，意识到可以利用古族之力与玄天司对抗，于是替十一月解毒，打算招募她为自己所用。不料玄天司黍离带领追兵包围小树林，二人陷入险境，葛覃也于此时现身。葛覃强行要带走十一月，不惜与逸徇爆发冲突，两伙人在树林大战。战斗中逸徇无意间触发自己古族的血脉，复刻了十一月的图腾，并且借助其灵力，带领重伤的十一月一起脱逃。逸徇在十一月的带领下前往古族圣地，从中了解了古族的历史，也确定了自己的古族身份。但二人无意间惊动镇守圣地的神兽应龙，为救十一月逸徇再次复刻图腾，激活自己体内的古族血脉。两人刚刚脱逃，便遇到了外出采药的少女楚茨。逸徇带着二人重返上石郡，在北城门处设计摆了葛覃一道，将十一月神不知鬼不觉带入了城中。逸徇入住郡守府，楚茨身份揭晓，竟然也是古族。但十一月伤势未愈，为了医治十一月，楚茨与逸徇打算一同进山寻药。彼此陌生的逸徇与楚茨二人在采药过程中相互猜忌，不幸遭遇了野熊决明。决明在看见血液后暴走，他的背后似乎有关于玄天司的秘密。于是逸徇、楚茨合力制服决明，取得草药下山回府。逸徇也终于下定决心与古族联手合力对抗玄天司，却遭到贴身护卫弈的反对，弈甚至暗中派人毁掉草药。所幸楚茨利用灵力救活草药，十一月才得救苏醒。而葛覃通过跟踪逸徇，得知了决明的下落。原来决明是玄天司研究的变异古族，于是葛覃秘密派出其他变异古族去抓捕决明...
故事发生在以武为尊的九霄大陆，讲述了现代学生林枫，因为一场意外，醒来成为武魂未觉醒的“废物”林家大少爷。从此以双武魂之力，一路修炼突破、披荆斩棘，收获知己红颜、得惊世传承的故事。
