故事背景设定在以现实世界为基础所衍生的架空世界，叙述日本在津轻海峡另一侧的北海道遭到占领，形成南北两侧对立的舞台。 1945年，苏联背弃日苏中立条约，于十月攻占北海道。日本恢复主权后，北海道也被改名为“虾夷”，归入苏联的体制之下。1965年赫鲁雪夫在第二十届共产党大会上宣布统合苏联、东欧与西亚所有共产主义国家的统一政体“联邦国”诞生。 1960年代后半，虾夷内部民族主义运动高涨，为了因应这个情势，联邦国于1975年与日本断交，使日本南北分裂情势延续至今。 联邦国在虾夷上建造有着高度直达云端、被称为“联邦国巨塔”的神秘建筑物，该神秘巨塔因此造成美国与联邦国的军事冲突点。

ある夏の一番暑い日、彼女と、彼女の飼い猫である“僕”の暮らしが始まった。 彼女は、通っている短大の卒業を控え、就職活動に追われる毎日を送っている。いつも頑張っている彼女にとって、“僕”と過ごす時間は、互いにひと時の安らぎを感じられる、とても大切なものだった。しかし、家族のことや、友達のこと、将来のこと…いろいろなことがうまくいかず、彼女は次第に傷つき、立ち止まってしまいそうになる。 それでも彼女は、背筋を伸ばし、今日も扉を開けて外の世界へと踏み出していく。そんな大好きな彼女のことを、“僕”はいつまでも見守っていたいと思っていた。

「想要试着去往那道光芒当中」 高中一年级的夏天。从离岛离家出走，来到东京的帆高。 他的生活立刻变得困窘，在度过孤独的每一天之后终于找到的工作， 是为古怪的超自然杂志撰稿。 如同预示着他接下来的命运一般，连日不断降下雨水。 此时，在人潮熙熙攘攘的都市一角，帆高遇到了一位少女。 由于某些缘故，和弟弟两个人一起坚强生活的少女·阳菜。 她拥有不可思议的能力。 「呐，现在开始就要放晴了哦」 雨水逐渐停止，街道笼罩在美丽的光芒中。 那是，仅仅在心中祈祷，就能让天空放晴的力量——

生活在日本九州田舍的17岁少女・铃芽遇见了为了寻找“门”而踏上旅途的青年。 追随着青年的脚步，铃芽来到了山上一片废墟之地，在这里静静伫立着一扇古老的门，仿佛是坍塌中存留的唯一遗迹。 铃芽仿佛被什么吸引了一般，将手伸向了那扇门…… 不久之后，日本各地的门开始一扇一扇地打开。 据说，开着的门必须关上，否则灾祸将会从门的那一边降临于现世。 星星，夕阳，拂晓，误入之境的天空，仿佛溶解了一切的时间。 在神秘之门的引导下，铃芽踏上了关门的旅途。