まとまった休みを利用して、恩師の小林オペラを訪ねるため、ロンドンの地に降り立ったシャロ、ネロ、エリー、コーデリアのミルキィホームズたち。 ロンドンに着いた早々、ひったくりの現場に遭遇した4人は、被害にあった女の子を持ち前のトイズを駆使して助け出す。彼女の名前はリリー・アドラー。 ミルキィホームズのトイズの力を目の当たりにしたリリーは、シャロたちの薦めに従い、小林オペラに対して、盗まれた自宅の絵画を取り戻して欲しいと依頼する。彼女のひいお祖父さんジョン・アドラーが描いたもので、市場価値はないが、家族にとってとても大切なものだという。依頼を受け、早速動き出す小林とミルキィホームズ。 すると、他にもジョンの描いた絵画がロンドン市内で2点も盗まれていることが判明する。無名画家の絵画が、なぜ3点も盗難に。単なる絵画盗難事件ではないという危惧を感じた小林は、ミルキィホームズたちと他の被害者宅を訪れるが･･･。

テムズリバーフェスティバルで大いに盛り上がるロンドン。 ミルキィホームズたちは、リリーと共にロンドンの休日を大いに楽しんでいた。 先日の事件で怪盗が残した言葉の意味を図りかねて自宅に残っていた小林は、 帰宅したリリーが口にした彼女の曾祖母の名前から、隠された謎の一端を解明に漕ぎ着ける。 時を同じくして、大英博物館で秘宝「ウィドウズ・エッグ」が盗まれるという事件が発生。 急いで現場へ駆けつけたミルキィホームズ、リリー、小林の一行がそこで見たものは･･･。

せっかくトイズが戻ってきたのもつかの間、またまたトイズを失ってしまったミルキィホームズの4人。好敵手の復活を強く望む「怪盗帝国」のリーダー・アルセーヌは、ミルキィホームズがトイズを取り戻すようにと、陰になり日向になり4人をサポートするが4人にトイズが復活する気配は全くない。それどころか、4人は貧乏生活にすっかり慣れ、ダメダメ街道まっしぐら。遂にはトイズだけでなく、学院生活に一番大事なものもすっかり忘れてしまい･･･。