まとまった休みを利用して、恩師の小林オペラを訪ねるため、ロンドンの地に降り立ったシャロ、ネロ、エリー、コーデリアのミルキィホームズたち。 ロンドンに着いた早々、ひったくりの現場に遭遇した4人は、被害にあった女の子を持ち前のトイズを駆使して助け出す。彼女の名前はリリー・アドラー。 ミルキィホームズのトイズの力を目の当たりにしたリリーは、シャロたちの薦めに従い、小林オペラに対して、盗まれた自宅の絵画を取り戻して欲しいと依頼する。彼女のひいお祖父さんジョン・アドラーが描いたもので、市場価値はないが、家族にとってとても大切なものだという。依頼を受け、早速動き出す小林とミルキィホームズ。 すると、他にもジョンの描いた絵画がロンドン市内で2点も盗まれていることが判明する。無名画家の絵画が、なぜ3点も盗難に。単なる絵画盗難事件ではないという危惧を感じた小林は、ミルキィホームズたちと他の被害者宅を訪れるが･･･。

　　トイズの戻ったミルキィホームズは今日も絶好調！次々と怪盗事件を解決していく。そんなある日、4人を満足そうに眺めるアンリエット生徒会長はふと考える。「そろそろ探偵学院を卒業させてもいいのでは？」 　　そうして行われることとなった卒業試験、アンリエットが試験として選んだ事件はヴァンガードファイター、先導アイチのカード盗難事件だった！ 　　アイチの思い出のカードを取り戻すため、ミルキィホームズ最後の事件に挑みます。 注：标题中的“サイコの挨拶”是“最後（さいご）の挨拶”的谐音双关语。“最後の挨拶”是福尔摩斯系列第四部短篇小说集及其中的一篇小说之标题《最后致意》（His Last Bow）的日文译名。

せっかくトイズが戻ってきたのもつかの間、またまたトイズを失ってしまったミルキィホームズの4人。好敵手の復活を強く望む「怪盗帝国」のリーダー・アルセーヌは、ミルキィホームズがトイズを取り戻すようにと、陰になり日向になり4人をサポートするが4人にトイズが復活する気配は全くない。それどころか、4人は貧乏生活にすっかり慣れ、ダメダメ街道まっしぐら。遂にはトイズだけでなく、学院生活に一番大事なものもすっかり忘れてしまい･･･。

テムズリバーフェスティバルで大いに盛り上がるロンドン。 ミルキィホームズたちは、リリーと共にロンドンの休日を大いに楽しんでいた。 先日の事件で怪盗が残した言葉の意味を図りかねて自宅に残っていた小林は、 帰宅したリリーが口にした彼女の曾祖母の名前から、隠された謎の一端を解明に漕ぎ着ける。 時を同じくして、大英博物館で秘宝「ウィドウズ・エッグ」が盗まれるという事件が発生。 急いで現場へ駆けつけたミルキィホームズ、リリー、小林の一行がそこで見たものは･･･。