《咕噜咕噜魔法阵》讲述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令悬赏，如果有人能够消灭魔王将会得到五万R并且能够成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、强迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去拜访 魔法婆婆的规则，按照这个规则，仁杰到达了魔法婆婆的家，勇者被命令和能够使用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一起踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒企图征服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。
主人公小林是一位女性系统工程师，某天她喝酒喝的很醉兴冲冲的跑到了山上遇到了一头龙，酒醉之下的小林对着龙大倒苦水。听到龙说自己无家可归时，小林趁着酒意开玩笑的说“那你就来我家吧”，之后龙真的就跑到小林的家里，并且还变成了一位女仆——于是一位龙女仆和小林的同居生活就这样开始了……
成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。
