《咕噜咕噜魔法阵》讲述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令悬赏，如果有人能够消灭魔王将会得到五万R并且能够成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、强迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去拜访 魔法婆婆的规则，按照这个规则，仁杰到达了魔法婆婆的家，勇者被命令和能够使用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一起踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒企图征服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。
时代的流淌逐渐泛起波澜。 乱世中，为野心而养精促锐者、企一展雄图者、为该守护之物而战斗者…… 这样，拥有不同梦想的人被命运的蚕丝牵结。 缔结成姊妹的关羽和张飞。 究竟，有何物在其前行之路上等待着呢？ “吾名为关羽。与吾一起平定此乱世吧！”
国中毕业之后，热爱棒球的少年泽村荣纯（逢坂良太 配音）准备放弃理想，和朋友们一起在家乡的高中完成学业，然而，此时，泽村却收到了青岛高校棒球社副社长高岛礼（内山夕实 配音）的邀请，邀请他加入棒球队。要知道，青岛高校可是棒球远动员们心目中的圣地，无数前途无量的棒球选手们出自这所学校，泽村接受了这千载难逢的机遇。 在球队里，泽村结识了一群志同道合的朋友们，心直口快大大咧咧的御幸一也（樱井孝宏 配音）、外表冷漠内心单纯的降谷晓（岛崎信长 配音）、身材矮小却实力强悍的小凑春市（花江夏树 配音）、看似腹黑却十分温柔的仓持洋一（浅沼晋太郎 配音），一行人为了完成称霸甲子园的梦想而不断挥洒着汗水，挑战着自我。
纱仓响（法伊鲁兹·爱 Fairouz Ai 配音）是一个对美食非常热衷的女子高中生，从来没有考虑过饭量和身材之间的关系的响，因为某一天被朋友说长胖了而整个人生都受到了颠覆。夏天眼看着就要来了，不能再这样下去了！纱仓响决定开始健身，而仅凭一己之力想要坚持下去是很不容易的，于是，纱仓响来到了健身房。 运动万能成绩优异的学生会长奏流院朱美（雨宫天 配音）、温柔体贴的上原彩也香（石上静香 配音）、虽然身为俄罗斯留学生日语却非常流利的吉娜·波特（东山奈央 配音）、拥有着不为人知的秘密的教师立花里美（堀江由衣 配音），在健身房里，纱仓响很快就交到了朋友。
“虫”既不是动物，也不是微生物，而是一种自然界中无处不在的力量，拥有独特的生命形态，偶尔和人类生命产生交汇，便生出一些奇妙的故事。但人们即使得知了“虫”的存在，大部分时候也不知如何应对，这便需要“虫师”出马。 银古就是一位虫师，他一头银发，年纪尚轻，但已经半生游历，经过一个个山野、村庄，为人们解决“虫”的问题，通过和被“虫”困扰的人们接近，他也接近了许多故事。银古的游历像风一样，再惊心动魄的“虫”似乎都融化在水墨样的山峦叠嶂间，芸芸众生也是过眼云烟，淡淡的故事里没有哀伤只有静穆。
本次故事舞台在自由、热情的海滨城市——新旧金山。搬到这里的无敌，遇到了一位自称DJ的男子。而DJ使无敌变身成为了名叫“无敌侠”的劲舞英雄。二人立志携手用歌声与舞蹈击退突然出现的怪物，守护整个城市。而这一切的背后，一场威胁整个人类的危机正暗流涌动……
