自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
转学到南葛小学的大空翼是一个热爱足球的少年，他在此结识了石崎、大姐头等一好友，还邂逅了最初的对手修哲小学的若林源三。热爱足球的孩子们齐聚求日本少年足球大赛，大空翼、若林、三杉淳、立花兄弟、若岛津健、日向小次郎等极具天赋的足球少年相继崭露头角，从小学到中学，这群孩子在球场上不断比拼磨练，相互赶超，渐渐成为了日本足球新生代的骨干。他们参加世青赛，远征欧罗巴，与当今世界上各路强者对决，跟昂首阔步迈近了世界杯的赛场…… 本片根据高桥阳一同名漫画改编，囊括“小学生篇”、“中学生篇”、“ジュニアユース篇”、“Road to 2002”等4个部分，共52话。
人気カードゲーム「デュエル・マスターズ」を題材とした松本しげのぶの漫画『デュエル・マスターズ ビクトリー』を原作とするテレビアニメ第２弾。監督の鈴木輪流郎をはじめとする前作の主要スタッフが、本作でもそのまま続投。五年生になった熱血小学生の切札勝太が、個性的なクラスメイトたちを相手に熱いカードバトルを繰り広げる。 エイリアンとの壮絶な戦いを終え、“日本一ビクトリーな奴”に輝いた切札勝太は、小学五年生として新学期を迎える。ぶっちゃけ、ヨーデル、べんちゃんたちと同じクラスになった勝太だが、個性豊かなメンバーが揃う新しいクラスはすでにハチャメチャな状態。更には２人の個性的な転校生が加わり、勝太たちは様々な騒動に巻き込まれると共に再び熱いデュエマを繰り広げていく。
